收到朱载坖的上谕之后，海瑞随即用王命旗牌命令丰城侯李寰，率军准备打破少林寺的山门，捉拿人犯。
这次来的宣大和蓟镇的边军，他们都身披甲胄，手持长兵，后面的火铳手火绳都已经点燃了，这下少林武僧所用的木棍对于官军来说是彻底没有效果了，他们刚要上前，就被官军的长刀大枪所逼退，在官军的武力恫吓之下，这些少林僧人不得已放弃了抵抗。
海瑞指挥锦衣校尉将一干人犯全部拿获，押回巡按御史行辕待审。
同时陆绎还借机抄走了少林寺的账册，同时锦衣卫和官军还在少林寺内发现了少林寺的银库，其中贮藏了大量的金银、粮食等物资，其数目之多，令海瑞都大为咋舌，海瑞赶紧下令将少林寺的银库封存，派遣锦衣校尉和官军看押起来，不准动这些金银等物资。
而了尘也被解运了京师，在朱载坖的严旨之下，锦衣卫和东厂联合办案，将各自的拿手绝活都给了尘的表演了一下，尤其是东厂的绝活弹琵琶，再给了尘好好弹了一下之后，了尘终于交代了他和少林寺的关系。
了尘确实曾是少林寺武僧，他的法名叫悟全，与上任少林寺方丈悟须是师兄弟关系，他是还是同乡，关系极为亲近，所以随着悟须在少林寺内的地位日渐提升，了尘也就越发的有恃无恐，在悟须当上方丈之后，了尘就被委以重任，承担起为少林寺收租子这一肥差。
少林寺除了在登封拥有土地之外，还在整个河南拥有大量的土地，而了尘的任务就是收取这些佃户的租子，少林寺的地租，比之一般的地主要高那么一点点，也就六成罢了，要知道河南的土地并不肥沃，而且由于水旱无时，河南经常遭灾，土地产出本就有限，在这种情况之下，了尘还向这些佃户们索要地租。
仗着有少林寺和少林武僧作为自己的后台，了尘对这些佃户敲骨吸髓，极尽盘剥之能事，甚至将无力给付地租的佃户的儿女卖掉，将其中有姿色的卖汝青楼，地方官府轻易不敢管这些秃驴，但是了尘久走夜路必撞鬼，还是踢到了铁板之上。
有一次了尘在开封收取地租，逼死一家八口，为时任河南巡抚的谢存儒所知，谢存儒当然不会惯着了尘，何况在开封府发生了这等惨案，他这个巡抚不能无动于衷，当时又正值师尚诏起义刚刚被平息，谢存儒生怕因此再次激起民变。
所以谢存儒以巡抚之威，逼迫少林寺交出了尘，要将其法办，以安抚民心。而这个时候了尘当然是逃回少林寺请求自己的方丈师兄救命，悟须很清楚，谢存儒堂堂巡抚，要是自己不给他面子，必定是没有好果子吃的，在经过商量之后，悟须决定玩一手偷梁换柱，瞒天过海。
悟须等人一面杀了几个不相干的百姓，将其剃度冒充和尚，回复谢存儒了尘等人已经畏罪自杀，经此一事，了尘是不能待在少林寺了，在悟须等人的谋划之下，原本的悟全变成了了尘，先到开封相国寺，然后又到了汝宁府崇光寺。
也正是在悟须等人的帮助之下，了尘才能成为汝宁府的僧官。
到了崇光寺之后，了尘凶性不改，继续劫杀过往的富商，获取他们的钱财，同时大部分所得都交给了少林寺，用于打点上下关系，正式由于有少林寺的庇护，了尘等人才能在汝宁府连续作案十多年之久而不被察觉。
同时了尘所经营的钱庄，实际上就是帮少林路放高利贷的工具罢了，了尘和少林寺沆瀣一气，狼狈为奸，据了尘的招供，他所得的钱财，大部分都上供给了少林寺，这事他的师兄弟们都知道。
而且少林寺在河南的产业甚多，据了尘的交代，据他所知，少林寺在河南不仅有各种店铺、钱庄等产业，甚至赌场、青楼，都有所涉及，还他妈真是多元发展。
了尘的口供到了朱载坖的案头之后，朱载坖召集阁臣和三法司重臣，将了尘的口供给这些重臣们看，朱载坖说道“如这般恶僧，朕必定严办，以彰朝廷之法度也”
刑部尚书赵文华说道“陛下，以臣之间，可将了尘的口供转发河南，由海瑞等严审少林寺僧人，取得口供，两相印证之下，即可得知实情，昭告天下，此案可定也”
赵文华不愧是老刑名，他很清楚，仅凭了尘一人的口供，就想做实此事是很困难的，少林寺毕竟是禅宗祖庭，朱载坖要办此案，必须要办成铁案，使得天下人心服口服才行。
朱载坖点头说道“将了尘的口供副本，发河南，要求海瑞、王鼎爵、赵志皋严审涉案僧人，务必要拷问出实情”
同时河南的奏疏也已经到了京师，海瑞将他到了登封以来所遇到的情况还有现在已经查实的部分案情上奏朱载坖，少林寺僧人在河南各地兼并土地，欺男霸女，为了索取地租，逼死人命等事，都已经坐实了。
朱载坖下令先将查实的部分事实昭告天下，而了尘的口供到了河南之后，海瑞立即提审正道、悟通等人，海瑞将了尘的供状给他们二人看，海瑞说道“了尘已经交代了此事，二位还有什么可隐瞒的呢”
正道说道“大中丞，小僧并不知晓了尘所言之事，前任方丈悟须死后，小僧才来到少林寺的，还请中丞明鉴。”
海瑞没说什么，而是问悟通道“悟通法师，按了尘所言，他也是你的师兄弟了，不知他是你的师兄还是师弟啊”
悟通垂头说道“回禀大中丞，了尘是小僧的师弟。”
海瑞说道“这就难怪了，了尘供状上所言，你可曾知道啊”
悟通业推说不知，称这些事情只有已经去世的悟须和尚才知道，他们都不知情。
海瑞冷笑一声，说道“尔等还在这里避重就轻，抗拒天威”